Сам explorer.exe походу никак, он не хочет запускаться через runas. Но можно через runas запустить iexplore.exe, он может работать как и обычный explorer. Для упрощения можно написать небольшой BAT-скрипт:
runas /user:Администратор "C:\Program Files\Internet Explorer\IEXPLORE.EXE ::{20D04FE0-3AEA-1069-A2D8-08002B30309D}"
UPD:
Работает только с 6-м Internet Explorer'ом =(.